强直性脊柱炎应与下列疾病相鉴别：
1 类风湿关节炎（RA）：AS与RA的主要区别是：
(2) AS无一例外 有骶髂关节受累，RA则很少有骶髂关节病变。
(3) AS为全脊柱自下而上地受累，RA只侵犯颈椎。
(4) 外周关节炎在AS为少数关节、非对称性，且以下肢关节为主；在RA则为多关节、对称性和四周大小关节均可发病。
(5) AS无RA可见的类风湿结节。
(6) AS的RF阴性，而RA的阳性率占60%~95%。
(7) AS以HLA-B27阳性居多，而RA则与HLA-DR4相关。AS与RA发生在同一患者的机遇为1/1~20万。
2 椎间盘突出：该病限于脊柱，无疲劳感、消瘦、发热等全身表现，所有实验室检查包括血沉均正常。如有必要可进行CT或MRI或脊髓造影术以明确诊断。
3 结核：对于单侧骶髂关节病变要注意同结核或其他感染性关节炎相鉴别。
4 弥漫性特发性骨肥厚（DISH）综合征：该病发病多在50岁以上男性，患者也有脊椎痛、僵硬感以及逐渐加重的脊柱运动受限。其临床表现和X线所见常与AS相似。X线可见韧带钙化，常累及颈椎和低位胸椎。常有沿着至少四节相连的椎体前外侧有流注形钙化与骨化，然而骶髂关节和脊椎骨突关节无侵蚀，晨起僵硬感未加重，血沉正常。HLA-B27与此病无关。
5 强直性脊柱炎是血清阴性脊柱关节病的原型，在诊断时必需与骶髂关节炎相关节的脊柱关节病如银屑病关节炎（PsA）、莱特乐综合征（RS）等相鉴别。
