强直性脊柱炎患者掌握选用药物治疗的方法对于病症的改善是相当重要的。因为目前此病症尚无特效疗法，所以治疗的主要目的在于缓解疼痛、减轻炎症、强化锻炼及维持良好的姿势与功能。
针对这此项治疗原则，患者可选用有具有较强抗炎、止痛和解热作用的消炎药物。这些药物应进行连续治疗，待症状完全控制或消失后再逐渐减量，最好以能控制症状的最小量维持一段无症状期。但使用抗炎止痛药会出现胃肠道不适，肝、肾损伤，头痛及浮肿一系列不良反应，所以，强直性脊柱炎患者在治疗前后应定期检查血、尿常规及肝、肾功能等。
此外，约有25%的强直性脊柱炎患者，在病程中可发生虹膜睫状体炎。虹膜睫状体炎见于一侧或双侧，也可双侧交替发作，炎症持续时间一般半月左右，也可能非常顽固，经久不愈或反复发作，但很少导致失明。出现此种症状的强直性脊柱炎患者可选择皮质激素治疗，但对于出现外周关节炎、骶髂关节炎或脊柱炎的患者，不宜使用激素治疗的方法。
