幼儿尿路感染如果治疗不彻底，极易复发而转为慢性或导致肾发育障碍或肾瘢痕，使肾组织遭到严重损害，其后果十分严重。约1/3有症状的幼儿尿路感染患者有肾瘢痕形成，多发生在5岁以前，而其中约半数存在膀胱输尿管反流，以后即使已无菌尿，这些损害仍会随年龄增长而加重，最后可发展为慢性萎缩性肾盂肾炎，进而进展为肾衰竭。
因此，有学者认为凡患有尿路感染的幼儿，都应进行静脉肾盂造影检查，如肾盂造影有异常或治疗后持续有菌尿者，应做排尿期膀胱输尿管造影，必要时做膀胱镜检查。治疗幼儿尿路感染的原则和方法与成人类似，但特别要注意纠正尿路功能异常或器质性梗阻。对无症状细菌尿幼儿也宜积极治疗。抗生素的选择要以副作用小、尿液中药物浓度高、细菌耐药发生率低为原则。
另外，幼儿在护理方面亦很重要。应注意增加液体的摄入量和经常排空小便，这有助于提高疗效。洗澡时应避免盆浴，在患儿病重或脱水时，应先补液，待取得尿培养标本后再应用抗生素。
