正确治疗尿路感染病人的关键是正确的诊断。泌尿系感染的典型症状是排尿时的烧灼感，尿频，尿急，排出的尿液体积却很少。许多研究表明，在具有类似症状的妇女中，只有一半左右是泌尿系感染，约半数具有各种不同的原因，包括阴道炎，尿道区域周围的化学刺激，衣原体感染，淋病，偶然地也会因为机械刺激所引起，如安置不当的阴道隔膜。如果在病人的尿中并未发现细菌，必须想到这些另外的原因。
显然，关键的是要了解尿中是否存在明显数量的细菌。通过尿液的显微镜检查或培养，都可以完成明确诊断的任务。镜检的费用低，又能很快得到结果，无疑是一种较好的选择。先把在清洁容器中收集的尿液进行离心，然后对沉淀进行显微镜检查，以寻找白细胞和阴道上皮细胞。如果阴道上皮细胞的数目明显增高，提示样本的收集过程存在问题。当然也要注意是否存在细菌。
在高倍显微镜下，常常难以对是否存在细菌作出结论性判断，这时就需要对尿液沉淀物进行革兰氏染色。这样可以确定细菌是否存在，而且能判断存在细菌的类型。如果在每个油镜视野找到至少１个革兰氏阳性细菌，那么就具有诊断意义了。如果只找到革兰氏阴性菌，表明滋生的细菌很少，并提示应考虑上述的其他诊断。
如果是第一次感染，可以只根据镜检而不必培养。如果是反复感染，为了更彻底、更有效的治疗，进行细菌培养和药物敏感试验就显得十分必要。
