中医认为骨髓炎是附着于骨的深部脓疡，发病原因有内因和外因两种因素。
内因是身体虚弱、抵抗力下降;
外因或为热病后热毒未尽，深蕴入内流注于骨繁衍聚毒为病;或为金刃所伤、邪毒侵延注骨为病;或为筋伤后淤血化热、深蕴入里、留于筋骨、 经络阻隔、气凝血滞、腐筋蚀骨、蕴郁成脓、破溃而出。
中医认为基于骨髓炎的发病原因，所以骨髓炎的治疗也要充分体现内外兼治的原则。
内应扶养正气、提高机体抵抗力，增强机体对外来邪毒的抗病能力,主要采用养阴益气、温肾健脾、托里排毒等方法，这是治疗骨髓炎的关键。它不仅可以促进脓液、死骨的排出，窦道的早日愈合，还可以防止窦道的反复发作。
外治要从三步进行：
一要排毒，用具有排脓、腐蚀作用的中药，自内而外破坏窦道和死骨，促进脓液、死骨和无活力组织排出，使肉芽鲜红形成新鲜创面。
二要生肌，采用具有祛腐生肌、长肉敛疮作用的中药，自内向外促进骨髓、骨质、肌肉及皮肤组织再生和修复最后使窦口愈合。
三对大块死骨及病灶无法排出时,可采用手术方法进行病灶清理、死骨清除、连续灌洗术。对皮肤、软组织缺损严重，创面深陷呈漏斗状者应行带蒂肌瓣填充术，方能消灭死腔。
