治疗尿路结石从两方面考虑，一是治疗原发病如代谢紊乱、感染或已存在的解剖因素；另一方面是处理结石的并发症即梗阻，感染。最简单而有效的是大量饮水，稀释尿可延缓尿石生长及防止尿石再发，有感染时大量饮水多可促进引流。
改变尿ｐＨ也可防止结石复发，胱胺酸更易溶于ｐＨ在７．５以上的尿液中，苏打及枸橼酸钠可碱化尿液。别嘌呤醇口服可减少尿酸及２，８-双羟腺嘌呤的产生，故对控制该类结石复发有效。
既往手术适应证为：①结石过大，估计不能从尿路排出者；②伴发肾积水、感染，引致肾功能减退者；③经常发生严重疼痛及大量血尿，影响健康者；④急性梗阻性无尿或少尿；⑤经长期施用非手术疗法无效者。
对于输尿管结石，针刺和中药治疗效果都较好。在梗阻或感染较重的病例以及结石较大，用上法不能排出结石时，仍应考虑输尿管切开取石术。
较小的膀胱结石，可试用中药化石及抗感染治疗。如结石较大，则应做耻骨上膀胱切开取石及造瘘。近年来小儿肾结石多可经体外震波碎石处理；经内腔镜、经皮取石在小儿应用较受限。
