双肾囊肿是人们对单纯性肾囊肿及多囊肾的通称，无论是单纯性肾囊肿还是多囊肾均可在双肾表现。不同的是单纯性肾囊肿一般不会导致肾功能衰竭，而多囊肾得不到及时有效的治疗，往往会滑向肾功能衰竭、尿毒症的深渊。
双肾囊肿，可以是单纯性肾囊肿，也可能是多囊肾。两者的治疗方法也不尽相同。
如果双肾囊肿是单纯性肾囊肿，那么治疗起来会较为容易一些。因为单纯性的肾囊肿多不会引起肾功能衰竭。如果只是单个的肾囊肿，囊肿直径又很大的情况，可以用西医的去顶手术。不过，手术在给身体带来创伤性的同时还有一定的复发性。所以，在囊肿直径不大的情况下还是建议用微化中药治疗，在缩小囊肿的同时，还能保护肾脏的功能。
如果双肾囊肿是多囊肾。则其双肾囊肿的治疗一般不考虑手术治疗，西医的手术治疗虽能去除较大的囊肿，但并不能阻止肾衰竭的发生。从这一点看西医的手术治疗只是对症但不能治病，达不到保护肾功能的目的。再者，手术过程中对肾脏形成较大创伤的同时还具有很强的复发性，易使病情反复，加快肾功能衰竭的发生。
因此多囊肾的治疗，应从中医的角度，从瘀论治，辩证用药，改善全身的微循环。利用微化中药的活性成份，经双肾区渗透到达肾脏的病灶。经活血化瘀、袪瘀清除，从根本上减小囊肿，减少囊内压力，保护肾脏功能。
