腰椎间盘突出症在不同的发病阶段可表现为腰痛、腰痛伴腿痛、腿痛等症状，而临床上这类症状也较多。鉴别如下：
(1)强直性脊柱炎：是一种与遗传有关的疾病，发病年龄较轻，早期多表现为腰部、腰骶部或髋部疼痛，腰部板直。病向上发展可波及胸椎和颈椎，最后整个脊柱都可能僵直。X线片早期可见骨质疏松，小关节间隙模糊，周围韧带钙化呈竹节样变。活动期血沉可增快，类风湿因子阳性。少数患者有低热。
(2)腰椎结核：发病年龄较轻，持续腰痛无反复性发作，偶尔有放射性腿痛，多伴有低热、盗汗、食欲减退等结核中毒症状。一血沉增快。X线片可见椎间隙变窄，骨质破坏出现死骨。有时在肺内可查到原发病灶。
(3)腰骶管内肿瘤：腰骶管内以神经鞘瘤、脊膜瘤、脊索瘤等为常见，这些肿瘤可引起腰、骶、臀、腿痛，也可压迫马尾神经，导致双下肢感觉、运动障碍，因此要与中央型椎间盘突出相鉴别。前者的发病较缓慢，症状体征进行性加重,可在CT、磁共振检查中发现。
(4)椎体转移癌：一般年龄较大，疼痛为持续性，休息也不能缓解，病变部位有深叩击痛，晚期可出现恶病质。X线片可见骨质破坏，椎体压缩变扁，但椎间隙往往正常。
(5)椎体原发肿瘤：椎体可发生血管瘤、骨巨细胞瘤等，但少见。腰椎X线片可帮助诊断。
(6)腰椎后关节滑膜嵌顿：此症发作时多有腰部前屈加转的动作，疼痛剧烈，以腰部为主，压痛部位多在小关节处，放射不明显。推拿按摩手法治疗效果好。
(7)进行性腰椎滑脱：此类患者可出现腰、臀、腿痛，多见于老年女性。X线片可见腰椎小关节退变较重，多发生在腰4、5椎体，腰5上关节宽且向前增厚、突出，压迫神经根，故有时称“上关节突综合征”。近年来用CT扫描可清楚显示神经根受压情况，并可对神经根管做出测量。
(8)梨状肌综合征：可表现为臀部及下肢痛，一般无腰痛，常为慢性，可有急性发作。梨状肌紧张试验阳性，梨状肌触诊异常。
(9)臀上皮神经综合征：此症可表现为臀痛、腿痛，其特点是腿痛多不过膝。在臀部可触及直径约数毫米，长数厘米的痛性筋束，无神经根受压体征。
(10)腰3横突综合征：此症的最常见症状是腰、臀、腿痛，其特点是腰3横突部压痛，有时可发生股内收肌的疼痛及压痛，无神经根受压体征。
(11)骨质疏松症：多见于停经后的老年妇女，患者胸腰段脊柱呈广泛性骨质疏松，骨小梁变细、变少，椎体呈凹陷形改变，服用雌激素或钙剂等药物可使疼痛缓解。
(12)内脏疾病牵涉性腰腿痛：腹腔、盆腔脏器或腹膜外疾患常可通过交感链或交感神经节的交通支影响脊神经，引起腰部或腿部的疼痛。此类患者腰部活动可正常，无明显压痛点。
(13)神经根炎：单发的神经根炎多继发于椎间孔周围的病变，其感觉障碍多呈“手套”袜子”样分布，运动障碍较对称，多伴有自主神经功能紊乱的症状，如皮肤粗糙、患肢苍白、皮肤汗多或汗少等。此外，当腰椎间盘突出症仅出现腰痛症状时，应与单纯性腰痛相鉴别。
