强直性脊柱炎早期症状一般都有腰骶关节疼痛，是强直性脊柱炎最具特征性的症状，常为隐渐性疼痛。疼痛部位在腰椎以下，肛门以上，两臀部之间的骶髂关节，左右骶髂疼痛程度往往不一样，疼痛性质呈固定不移动的深层隐渐性疼痛。
骶髂关节呈隐渐性疼痛，疼痛部位固定不移是炎性关节疼痛的特点，是与腰椎间盘突出、腰外伤引起腰椎疼痛的重要区别点。可以影响睡眠，严重时疼痛可以使患者无法睡眠，甚至需要下床活动后，疼痛缓解才能重新入睡。更严重者翻身困难，下床困难。
强直性脊柱炎轻症者,仅会感觉骶髂关节部僵硬、肌肉酸痛。原因是肌腱、韧带与骶髂关节的骨附着点炎症，即肌腱末端炎。易误诊为腰椎间盘突出、风湿病。臀、大腿后侧疼痛易误诊为坐骨神经痛，但是强直性脊柱炎引起的下肢疼痛很少放射到膝以下。
强直性脊柱炎骶髂关节疼痛特点是休息不能缓解，活动后方能缓解，这也是与腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰部外伤的区别点。
