肾囊肿的诊断最主要依据肾脏B超检查，能了解囊肿的个数、大小、囊壁的情况，如查B超肾囊肿的检查发现有囊肿，脓性除外，多可确诊为肾囊肿。B超检查，并可与肾实质性肿块相鉴别，为首选检查方法。
典型的B超表现为病变区无回声，囊壁光滑，边界清楚；当囊壁显示不规则回声或有局限性回声增强时，应警惕恶性变；继发感染时囊壁增厚，病变区有细回声，囊内有出血时回声增强。当显像提示有多个囊肿时，应与多房性囊肿，多囊肾相区别。此外，对B超检查不能确定者有价值，囊肿伴出血、感染、恶变时，呈现不均质性，CT值增加，当CT显示为囊肿特征时，可不必再作囊肿穿刺。
肾囊肿的诊断要点有：
1.本病早期一般无症状，常在体检 B超时被发现，囊肿直径>10cm时，引起症状。主要为腰腹部胀痛囊内感染出血时疼痛加重。
2.体查偶可在腰腹部们到囊性包块。
3.B超常可明确诊断，怀疑有恶性变时可采用进一步检查所列的方法。
4.本病应与肾癌、肾积水、肾多房性囊肿、多囊性相鉴别。
