与X线检查相比，CT由于分辨力高，层面无干扰，能发现骶髂关节的早期病变，如CT可以准确测量和评价关节间隙和提高微小病变的检出率，从而有利于早期诊断和较准确定级。ＣＴ对Ⅰ～Ⅲ级骶髂关节炎的诊断常比Ｘ线平片敏感一个级别。CT既可明确，亦可排除X线平片的可疑诊断，重复性强，随访复查较准确。但CT检查也有不尽人意之处，如不能显示软骨、关节旁骨髓脂肪堆积等软骨下骨板侵蚀和硬化前的改变。即使在常规应用CT的年代，强直性脊柱炎诊断的平均病程也达6.5年，提示CT诊断早期骶髂关节炎的能力也是有限的。
骶髂关节CT表现：髂骨面病变出现率显著高于骶骨面，韧带部异常征象出现较晚。CT主要表现为骶髂关节间隙宽度异常，髂骨面骨皮质厚薄不均匀，关节面模糊不清，局灶性或弥漫性脱钙，关节前缘关节旁有不同程度斑块状/弥漫性骨质增生硬化，骨质边缘侵蚀呈毛刷状或锯齿状，软骨下囊变，骨皮质中断。晚期骶髂关节呈骨性强直，骨质多脱钙稀疏，韧带部侵蚀和囊变常见。
脊柱CT表现：椎体及小关节皮质密度增高、变厚，骨赘形成；骨松质密度减低；小关节间隙消失呈骨性融合，小关节囊骨化，椎旁韧带骨化形成骨桥，脊柱呈“竹节”样是本病的终末期表现。
