外伤性化脓性骨髓炎的主要病因是开放性骨折。开放性骨折的创面多受到严重的污染，由于条件的限制，如果骨折后延误治疗，清创不彻底，常引起创面部位感染。由于创伤后局部软组织渗出、出血，为致病菌的繁殖提供了条件，加之创伤局部血循环障碍，全身和局部的抵抗力均有下降，致病菌得以大量繁殖，继而发生骨骼感染，常见和部位为胫骨、股骨和肱骨。
在开放性骨折后，首选 在局部形成一个炎性病灶，组织水肿渗出，白细胞侵润，病灶内大量的炎性渗出使局部压力升高，形成脓肿。骨折断后端长期浸泡在脓液之中，继而发生骨膜、骨质和骨髓的的感染。由于创伤部位软组织损伤严重，骨膜撕裂、破损，缺乏血液供应，感染严重者可有大块死骨形成，尤其是粉碎性骨折继发感染后，由于骨碎片缺乏血供，更易形成死骨，当死骨脱落或摘除后，可导致骨缺损或骨不连。骨折断端如长期缺乏血液供应或侵泡于脓液中，可使局部骨质破化，在X线上可见局部骨密度增高。
脓肿引流后，病人全身症状减轻，局部炎症得到控制，引流外形成窦道，在数月或数年的时间内长期不愈，不断有脓液排出，有时可以排出少量死骨。有时窦道口可以暂愈合，但当病人全身抵抗力下降时，窦道外口可反复破溃。
