腰椎间盘突出症是以疼痛为主要表现的，其疼痛多为神经受压及软组织炎症引起的，以腰部及下肢疼痛为主。其疼痛虽有较固定的表现特点，但临床上内脏疾病也可引起腰痛或腰腿痛，应仔细分析鉴别，以防误诊误治。
腰椎间盘突出症引起的腰痛和腿痛一般发病突然或有明显的外伤史，疼痛多为锐痛，多伴有腰椎活动受限，下肢痛多沿坐骨神经分布放射，无发热，发病初期无大小便异常。而腹腔和盆腔内的脏器引起的腰部牵扯性疼痛一般不是唯一的症状，还有内脏疾病其它的临床表现，如泌尿系结石往往伴有排尿不通畅、尿痛、尿血等症状。妇科疾患伴有经、带、胎、产的变化。消化性溃疡的疼痛与饮食关系密切等。仔细观察病史不难发现它们的区别。
其次，内脏疾病引起的腰痛多为牵扯性疼痛，即内脏的病变刺激了痛觉传入神经纤维，通过交感神经干和交通支传入后根和脊髓的某一节段，将刺激转移、扩散到这一节段脊髓和神经根所支配的腰部皮肤、筋膜等组织，由此产生腰部的疼痛、压痛等症状。另外，在影像学检查上，内脏疾病引起的腰痛，腰椎一般无明显病理改变，而相应的内脏可有阳性结果，如泌尿系结石X线片可见结石影等。可以引起腰痛症状的内脏疾患有：
(1)消化系统疾患：如消化性溃疡、胰腺癌、直肠癌等。
(2)泌尿系统疾患：如肾盂肾炎、肾周围脓肿、肾结石、输尿管结石、肾结核、游走肾、前列腺炎等。
(3)妇科疾病：子宫体炎、附件炎、子宫后倾、盆腔肿瘤、子宫脱垂等。
(4)其它：如膈下脓肿、腹膜后肿瘤。此外，肾上腺、睾丸等器官的疾患也可引起腰痛。
